ti hanno chiesto il versamento perchè la DIA ha una durata di 3 anni dalla data di presentazione. se non hai dato la fine lavori entro i 3 anni per loro (il comune) significa che hai proseguito i lavori oltre il termine di scadenza della DIA stessa; ecco il motivo della sanzione.
fa presente all'ufficio tecnico che l'art. 36 comma 3 del DPR 380/01 (accertamento di conformità detta anche DIA in sanatoria) recita testualmente "3. Sulla richiesta di permesso in sanatoria il dirigente o il responsabile del competente ufficio comunale si pronuncia con adeguata motivazione, entro sessanta giorni decorsi i quali la richiesta si intende rifiutata."
quindi prevede che se l'amministrazione non si pronuncia entro 60 giorni la DIA s'intende NON ACCOLTA e questo potrebbe crearti problemi; ti consiglio di farti rilasciare un attestato di conformità da portare al notaio