Non si trascrive quasi mai; solamente in situazioni particolari.Leggendo solo certi siti, mi sembrava quasi una follia non trascrivere il preliminare. Fortuna esistono forum come questi.
Andrei tranquillo con la caparra piccola e il resto del malloppo a rogito (con sospensiva scritta bene, però!).
Se proprio vuoi pararti al 100%, come indicato, utilizzi l'artifizio del deposito prezzo: soldi in mano al Notaio, che trascrive la compravendita e iscrive ipoteca; quando vi è certezza che non vi siano state altre iscrizioni/trascrizioni prima di queste, il Notaio versa i soldi al venditore.
Ma anche questo è un artifizio che solitamente non viene fatto, e che tra l'altro ha un costo.