sono due problemi diversi.il problema non è il pozzo ,il problema è che il pozzo c'è se nel sottosuolo è presente acqua . Chiudendo il pozzo la vena di acqua nel sottosuolo resta .
come ti è già stato detto, l'acqua, sottoterra, c'è; dappertutto.
se la falda è in profondità (ed essendoci un pozzo direi che è una cosa che puoi verificare facilmente... basta calare il secchio) problemi non credo proprio che ne avrai.
se il pozzo è abusivo il problema è un altro. se devi chiedere il mutuo, il perito difficilmente chiuderà un occhio.
per questo ti proponevo di chiuderlo.
a cosa fatta nulla vi vieta di lasciare la strutture esterna del pozzo; se è ben tenuta è un bell'elemento nel giardino.