Che io sappia non è possibile annullare una registrazione se già stata effettuata, sia che sia avvenuta in maniera telematica che in forma cartacea.
L'unica soluzione è, come hai detto, la risoluzione anticipata.
Se vuoi la sicurezza assoluta però, chiama l'ufficio dove è stato registrato (quello che hai scelto come destinatario nella registrazione telematica).