Fai qualche esperimento, perchè dubito che il problema esista, senza offesa...
A volte tenendo il sito aperto, le notifiche possono anche saltare.
Lui ti avverte per ogni discussione che non stai leggendo mentre arriva una nuova risposta.
E funziona come un orologio svizzero.
Mentre per le e-mail ci possono essere molte cose da controllare, il meccanismo delle notifiche è decisamente più controllabile, resiedendo tutto nel Db.
Tieni conto come dicevo prima che se l'utente che sta scrivendo una nuova risposta clicca invio nel momento esatto in cui tu magari stai uscendo dalla discussione, la notifica scappa per il semplice motivo che il sistema crede che tu sia ancora li.