Probabilmente il tecnico non considera il catasto, come impropriamente cita
@avvagabbo , bensì la non conformità edilizia.
Il problema non è il catasto, il problema è l'abitabilità che non puoi avere se l'altezza non è quella minima prescritta (2.70 m, con qualche cm di tolleranza, in quasi tutti i locali).
Esiste la possibilità di deroga, per edifici datati, ma bisogna vedere se la situazione di questo immobile è derogabile. Se non lo è, ha ragione il tecnico del venditore: per essere in regola, bisogna portare l'altezza a 2.70m. Come farlo... è un problema del venditore, che diventa tuo se acquisti.